1．物流管理分散，整體效益較差。長期以來，我國物流行業管理一直沿襲計劃經濟體制的模式，使原本一個系統資源的物流業的管理權限被分別劃歸若干個部門。比如鐵路、公路、水運、航空等運輸資源、分別直屬鐵道部、交通部、航空總局等管理。物流管理和資源的分散化，物流企業的低效運作，使物流應具有的整體功能被大大削弱，阻礙物流業發展，難以形成社會性的物流配送體系。這種條塊管理體制，形成自上而下的縱向隸屬和管理格局，嚴重制約著物流的整體統籌和規劃，妨礙著物流的社會化進程，阻礙著電子商務的進一步推廣應用，發揮不了物流的整體效益。

　　2．物流企業基礎設施不配套，自動化網絡化程度低。我國傳統物流企業在基礎設施建設上投入不足，自動化信息程度低，在倉儲、運輸、配送各個環節仍然以手工作業為主，沒有自動化信息網絡，缺乏優化調度、有效配置，對客戶不能提供查詢、跟蹤等服務。在物流過程中，多數企業難以做到在預定時間送貨，并經常出現斷貨、對客戶的響應不及時等問題。從而造成物流組織效率低下，管理水平低，配送成本高，客戶滿意度差，盈利能力低，嚴重影響了物流行業的整體發展。

　　3．物流企業規模小，整體物流規劃不夠理想。目前，我國物流企業規模較小，物流管理又比較分散，物流部門條塊分割的現象比較嚴重，每個部門都自成體系，缺乏整體物流規劃，加上大多數物流企業運營方式單一，綜合性物流公司很少，使貨物倉儲、貨物運輸、貨物配送無效作業環節的增加，物流速度的降低和物流成本的上升，造成物流環節上的浪費，管理成本加大，因而導致各種物流功能、要素之間不能有效銜接和協調發展。

　　4．物流發展的專業化程度不高。當前我國物流運輸、倉儲的現代化水平還不高，物流中心和配送中心的建設以及集裝箱運輸的發展還比較緩慢，物流企業“大而全”、“小而全”的現象比較普遍，產、供、銷一體化，專業化操作程度較低，直接導致了物流作業過程的效率低下、成本過高，從而很難為合資企業或外資企業提供綜合性的物流服務，也很難使社會物流與企業物流一體化。

　　5．物流專業人才缺乏。當前我國在物流人才的教育和培養上比較緩慢，市場上符合要求的物流人才較少，并且層次較低，物流專業人才缺乏。由于物流教育和培訓的缺乏，能夠切實為企業提供有效方案的中高級物流人才較少， 制約了物流業的發展。

　　6．過路費、過橋費過高。據相關數據顯示，全世界收費公路14萬公里，其中有10萬公里在中國，占全世界70%。對于物流業而言，路橋費直接占到物流企業總成本的三分之一，路橋費的提高勢必會造成物流成本的增加，從而影響物流企業的發展。